Bush slávnostne vymenuje Muellera do funkcie v priebehu dňa na záhrade Bieleho domu, uviedli zdroje blízke administratíve amerického prezidenta.
Louis Freeh, ktorého vymenoval do funkcie v roku 1993 bývalý americký prezident Bill Clinton, mal často nezhody s Bielym domom. Odchod z postu riaditeľa FBI oznámil začiatkom mája. Freehov mandát na výkon funkcie šéfa federálnej agentúry na presadzovanie práva mal vypršať v roku 2003, pred dvoma mesiacmi však svojich podriadených listom informoval, že v júni "na konci školského roku" po 27 rokoch kariéry vo vládnych funkciách odíde.
Mandát riaditeľa FBI, ktorého menuje do funkcie prezident a potvrdzuje Senát, trvá desať rokov. Prezident George W. Bush požiadal Freeha, bývalého federálneho prokurátora a federálneho sudcu v New Yorku, aby vo funkcii šéfa FBI zostal. Päťdesiatjedenročný Freeh v liste neuviedol, kam pôjde, už predtým však vyjadril záujem získať lepšie platené miesto mimo vládnych služieb.
Mueller nepochádza z radov FBI, doteraz pôsobil na poste federálneho prokurátora v Kalifornii, kam ho v roku 1999 vymenoval Clinton. Predtým pracoval vo Washingtone ako šéf oddelenia vrážd pri úrade generálneho prokurátora, známy je aj dlhoročnou advokátskou činnosťou.
Na post šéfa FBI prichádza v čase, keď sa na úrad vyšetrovania vzniesla vlna kritiky, naposledy v súvislosti s prípadom atentátnika z Oklahoma City Timothyho McVeigha.