Jeho organizácia Džamá'a Islámíja (JI) je podozrivá z organizácie bombových útokov na ostrove Bali, ktoré si vyžiadali 12. októbra takmer 200 mŕtvych.
Bašírovi prívrženci začali na policajtov hádzať kamene v momente, keď ho odvážali z nemocnice na letisko, odkiaľ putoval na výsluch do 450 kilometrov vzdialenej Jakarty. Zrážky si vyžiadali nespresnený počet zranených na oboch stranách.
Asi 300 ozbrojených policajtov stálo pred nemocnicou zoči-voči stovkám nahnevaných prívržencov moslimského vodcu. Tí vykrikovali "Sme pripravení zomrieť" a v rukách držali transparenty s nápismi "My nie sme teroristi" alebo "Náš učiteľ neutečie".
Bašír v nedeľu vyhlásil, že proti zatknutiu sa bude brániť všetkými dostupnými prostriedkami. Zároveň povedal, že je ochotný odpovedať na otázky vyšetrovateľov.
Medzi vyše 180 obeťami explózií na Bali je väčšina austrálskych turistov. Indonézia, ktorú už v minulosti susedia kritizovali za nedostatočné úsilie pri pátraní po radikálnych skupinách, zvýšila po útokoch svoje úsilie v boji proti terorizmu.