Prokuratúra žiadala doživotie, potom ako mu súd v stredu dokázal vinu, no 12-členná porota prejavila zhovievavosť voči Ntuyahagovi, pretože "zachránil niekoľko tutsijských priateľov".
Ntuyahaga bol usvedčený z úkladnej vraždy, keď nechal zlynčovať belgických vojakov, potom ako ich rwandská armáda zadržala a previezla do "Tábora Kigali". Vojaci mali pôvodne eskortovať rwandskú premiérku Agathe Uwilingiyimanovú, ktorá bola z kmeňa Tutsiov. Uwilingiyimanovú mala predniesť verejný prejav k národnej jednote, potom ako bolo lietadlo s rwandským prezidentom Juvenalom Habyarimanom, ktorý patril medzi Hutuov, zostrelené neznámymi útočníkmi.
Ntuyahaga poprel všetky obvinenia vrátane vraždy svojich susedov a bývalej manželky, keď sa pred genocídou snažili ujsť z hlavného mesta Kigali. Súd oslobodil bývalého majora oslobodil spod obvinení z vraždy premiérky Uwilingiyimanovej.
Ntuyahaga bol súdený v Bruseli na základe zákona, ktorý umožňuje súdiť podozrivých zo zločinov proti ľudskosti v prípade, že sa zločiny týkajú Belgicka. Ntuyahagov proces bol zároveň tretím, ktorý sa v Belgicku konal v súvislosti s rwandskou genocídou.
Zavraždenie rwandského prezidenta spustilo genocídu, ktorá si vyžiadala približne 800 tisíc životov, najmä spomedzi menšinového kmeňa Tutsiov a umiernených Hutuov. Belgickí vojaci sa stali obeťou vraždenia, pretože boli obvinení z účasti na Habyarimanovom zabití.