Kooperáciu však bude sťažovať skutočnosť, že medzi obidvoma krajinami neexistujú dohody o vydávaní osôb obvinených z vojnových zločinov.
Napriek tomu justičné úrady očakávajú, že dohoda zlepší spoluprácu pri výmene údajov a sprostredkovaní svedectiev.
Chorvátsky generálny prokurátor Mladen Bajič a srbský špeciálny prokurátor pre vojnové zločiny Vladimir Vukevič vyhlásili, že dohoda taktiež obmedzí možnosti, aby údajní vojnoví zločinci, po ktorých pátrajú obe krajiny, nachádzali úkryt vo svojej vlasti.